Ao longo dos anos a cidade de Curitiba foi crescendo e a SEB, observando a demanda por profissionais da área de saúde, fundou o Centro de Estudos e Pesquisas Evangélico. Percebendo a força da qualidade do ensino oferecido, em 1969 nasceu a Faculdade Evangélica do Paraná. Em 2 de janeiro de 1969 foram iniciadas as aulas do Curso de Medicina. Em dezembro de 2000 a Faculdade de Medicina do Paraná (FEMPAR) passou a ser denominada Faculdade Evangélica do Paraná (FEPAR). Em 22 de maio de 2006 foi autorizado pelo Parecer nº 140/2006 o aumento de 40 vagas anuais, passando a oferta ser de 100 vagas ano, com duas entradas semestrais de 50 vagas em cada semestre. O currículo do Curso de Medicina deixou de ser apresentado de forma seriada anual e passou a ter apresentação seriada semestral. O projeto de transformação curricular do Curso de Medicina foi aprovado pelo Edital Pró-Saúde I (nº 2101) da Secretaria da Gestão do Trabalho e da Educação na Saúde do Ministério da Saúde, tendo início o processo de estudo e viabilização da reforma curricular, que visava reorientação da formação, ampliação do internato, diversificação de cenários de ensino-aprendizagem, desenvolvimento docente e integração das disciplinas. A Portaria MEC nº 19, de 29 de janeiro de 2014, autoriza o aumento de 20 vagas anuais para o Curso de Medicina, passando a ofertar 120 vagas anuais. Em 2016 houve a renovação do reconhecimento do Curso por meio da Portaria nº 745/2019. Em 20 de novembro de 2018, o INSTITUTO PRESBITERIANO MACKENZIE associação civil filantrópica, confessional com finalidade educacional, social, assistencial e de saúde, sem fins lucrativos e econômicos, com sede em São Paulo - SP, torna-se instituição mantenedora da Faculdade Evangélica do Paraná que então passou a denominar-se FACULDADE EVANGÉLICA MACKENZIE DO PARANÁ – FEMPAR.
